黄林团队开发一种促进RNA结构解析方法及其应用的新技术在Nucleic acids research杂志发表
论文题目:A general strategy for engineering GU base pairs to facilitate RNA crystallization.
通讯作者:黄林等
第一作者:任洋逸;林晓伟
论文发表刊物:Nucleic acids research
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【研究背景】
RNA分子在细胞内具有重要的催化和调节功能,其三维结构的准确折叠是发挥功能的关键。然而,高质量RNA晶体的获得极为困难,目前功能性RNA结构解析数量有限,严重阻碍了RNA相关疾病机制研究和靶向治疗开发。虽然AlphaFold在蛋白质结构预测中取得突破性进展,但RNA结构预测仍面临巨大挑战,迫切需要大量高分辨率RNA结构数据支持。因此,开发新方法促进RNA晶体生长与解析,解决临床和基础研究中的RNA相关问题,具有重要意义。
【主要发现】
本研究提出通过GU碱基对替换标准碱基对(GC/AU),显著提高RNA晶体质量和分辨率。在8种RNA晶体中,6种通过GU替换显著提高了分辨率,另1种观察到GU与Ba²⁺结合,还有1种去除GU提高了分辨率。并且研究表明5’双螺旋茎是最有效的改造位点,替换或去除GU增加序列多样性,为RNA结构解析和晶体学研究提供了新策略。
【研究意义】
本研究通过创新性引入或去除GU碱基对,显著提高RNA晶体质量和分辨率,解决了RNA晶体难以形成和衍射数据质量低的问题。该方法拓宽了RNA结晶策略,为解析RNA结构、研究其功能及催化机制提供了强有力的工具。同时,该研究成果有助于RNA靶向药物开发、RNA相关疾病机制解析及基因编辑技术发展,具有重要的科学与临床意义。
论文链接:
https://doi.org/10.1093/nar/gkae1218
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