廖建友、尹东研究员团队系统揭示RNA结合蛋白与疾病关联及其多功能性的新版本研究平台-RBPWorld在《Nucleic Acids Research》杂志上发表
论文题目:RBPWorld for exploring functions and disease associations of RNA-binding proteins across species.
通讯作者:尹东;梁茂金;廖建友 等
第一作者:廖建友;杨兵;石川平
论文发表刊物:Nucleic Acids Research
【研究背景】
RNA结合蛋白(RBPs)在多种生理和病理过程中发挥关键作用,尤其是在癌症等复杂疾病的调控中。尽管RBPs的重要性日益凸显,但大多数RBPs的功能仍不清楚。随着基因组学和蛋白质组学数据的快速积累,系统性地研究RBPs的功能和疾病关联成为可能。
【主要发现】
研究团队通过机器学习预测和广泛的数据整理,成功鉴定出1,393,413个RBPs,涵盖445个物种,包括3,030个人类RBPs(hRBPs)。研究还系统鉴定出929个多功能RBPs,包括作为代谢酶和转录因子等的hRBPs,以及838个与疾病相关的hRBPs和970个与12种致病RNA病毒相互作用的hRBPs。这些发现为理解人类RBPs在疾病中的调控作用提供了新的视角。
【研究意义】
RBPWorld平台为研究人员提供了一个宝贵的资源,用于探索RBPs在不同物种中的功能和疾病关联。该平台不仅有助于深入理解RBPs在癌症等疾病中的作用,还为开发新的治疗靶点和诊断标志物提供了理论基础。通过RBPWorld,研究人员可以轻松访问和分析大量的RBPs相关数据,推动对RBPs在临床应用中的进一步研究。
论文链接:https://academic.oup.com/nar/article/53/D1/D220/7875982?login=false
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