朱亚锋团队通过蛋白质基因组学分析揭示人类和小鼠基因组存在细胞或组织特异性表达小开放阅读框在Nucleic Acids Research杂志发表
论文题目:Proteogenomics-enabled discovery of novel small open reading frame (sORF)-encoded polypeptides in human and mouse tissues.
通讯作者:朱亚锋 等
第一作者:杨梅;谢玉婷;王凌朔
论文发表刊物:Nucleic Acids Research
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【研究背景】
小开放阅读框(small open reading frames, sORFs)通常指长度不超过100个密码子的开放阅读框,近年来被认为是编码功能性微蛋白(microproteins)或sORF编码肽(SEPs)的重要来源。SEPs能够通过不同的模式调节基因表达从而调控癌细胞的增殖或者迁移,与癌症的发生发展密切相关。尽管已有研究通过核糖体图谱(Ribo-seq)和质谱蛋白质组学(MS)技术鉴定出部分sORFs,但大多数研究局限于少数癌细胞系或单一组织,限制了对sORFs在复杂生物系统中表达与功能的全面理解。
【主要发现】
本研究开展了一项跨组织、跨物种的sORF发现研究,提出并验证了一种高效、系统的sORF发现策略,突破了以往研究在样本数量和组织广度上的限制,识别并验证人与小鼠组织中新型sORF编码多肽。在人类淋巴细胞、小鼠视网膜和胚胎期的胃组织发现的新型sORF在免疫调节或者组织发育过程中可能具有重要的生物学功能。

【研究意义】
本研究为sORF的系统发现与功能注释提供了新的范式,拓展了人类与小鼠蛋白质组的边界,也为未来疾病相关微蛋白的研究奠定了基础。随着蛋白质组学技术的不断进步,sORF及其编码肽有望成为疾病标志物、治疗靶点及新型功能蛋白的重要来源。
论文链接:
https://doi.org/10.1093/nar/gkaf687
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