基础与转化医学研究中心
郭雅彬
职称:研究员
科室:基础与转化医学研究中心
概述

个人简介:

中山大学百人计划引进人才。科研项目:主持国自然面上项目、广东省自然自由申请项目各二项。科研成果:①开发出一个具有强肿瘤杀伤活性的单抗(AD5-10),该抗体的ADC版本处于临床实验阶段。②率先使用二代测序研究转座子的整合,建立了一套制备转座子整合文库二代测序样品制备的完整方法,编写了一套分析转座子整合二代测序结果的计算机程序。在日本裂殖酵母中发现了10种全新的吉普赛家族转座子,首次证明裂殖酵母中有整合于tRNA基因区域的转座子。③首次发现alpha和beta卫星DNA广泛分布于真核生物基因组且在进化史上发生过大量的水平转移。④首次发现并证实Sleeping Beauty转座子能够整合于非TA位点,并首次发现转座子末端序列能够影响整合位点选择。⑤开展了用转座子筛选肿瘤相关基因领域最大的一次筛选,建立了一个包含5000多个基因的癌症相关基因数据库,发现了多个未报导过的新癌基因/抑癌基因候选。用CRISPR基因组编辑术实现了人类细胞中的系统性染色体重排,并推广到线虫和水稻等不同的实验模型中。迄今在Nucleic Acids Research、Genome Research、Cancer Research、GenomicsGenetics、JBC等期刊发表论文20余篇,总被引用1100多次,H指数13。研究方向:①染色体重排与基因组进化;②核小体排布与定位;③转座子生物学。

 

联系方式:guoyb9@mail.sysu.edu.cn

 

主持项目:

1. 国自然面上项目,32170641,用CRISPR-Cas9引发系统性染色体重排重塑人类细胞基因表达谱的研究,2022-2025 (主持)

2. 广东省自然面上项目,2021A1515011183,人类细胞中染色体系统性重组方法的建立与初步研究,2021-2023(主持)

3. 国自然面上项目,81872295,用Sleeping Beauty转座子筛选肺癌发生及抗药性相关基因,2019.1-2022.12(主持)

4. 广东省自然自由项目,2018A030313819,逆转座子LINE-1反向转录嵌合RNA在乳腺癌发生中作用的研究,2018.5-20 21.4(主持)

5. 广州市科技重点研发计划,2024B03J1363,基于CRISPR-Cas9的水稻系统性染色体重排技术研究与分子育种应用,2024.1-2026.12(共同主持第二)

 

主要论文:

1. Li J, Yuan P, Ma G, Liu Y, Zhang Q, Wang W*, Guo Y*. The composition dynamics of transposable elements in human blastocysts, J Human Genetics. 2023 Oct;68(10):681-688.

2. Liu Y, Ma G, Gao Z, Li J, Wang J, Zhu X, Ma R, Yang J, Zhou Y, Hu K, Zhang Y*, Guo Y*. Global Chromosome Rearrangement Induced by CRISPR-Cas9 Reshapes the Genome and Transcriptome of Human Cells, Nucleic Acids Research 2022 Apr 8; 50(6): 3456–3474.

3. Cui Y, Guo Y*. The local integration preference of the Tf1 retrotransposon in Schizosaccharomyces pombe, Virology 2022; 565:52-57.

4. Zhang Y, Huang Y, Jin X, Chen J, Peng L, Wang DL, Li Y, Yao XY, Liao JY, He JH, Hu K, Lu D, Guo Y*, Yin D*. Overexpression of lncRNAs with endogenous lengths and functions using a lncRNA delivery system based on transposon, Journal of Nanobiotechnology 2021; 19(1):303.

5. Zhou Y, Ma G, Yang J, Gao Z, Guo Y*. The integration preference ofSleeping Beauty at non-TA site is related to the transposon end sequences, Frontiers in Genetics 2021;12:639125.

6. Yang J, Yuan B, Wu Y, Li M, Li J, Xu D, Gao ZH, Ma G, Zhou Y, Zuo Y, Wang J, Guo Y*. The wide distribution and horizontal transfers of beta satellite DNA in eukaryotes. Genomics 2020;112(6): 5295-5304.

7. Hu K, Li Y, Chen H, Wu W, Zhang R, Yan H, Chen Z, Zhang Y, Wei J, He J, Liao J,  Li J, Guo Y*, and Yin D*. High-performance gene expression and knockout tools using Sleeping Beauty transposon system. Mobile DNA 2018; 9.

8. Guo Y*, Zhang Y, Hu K. Sleeping Beauty transposon integrates into non-TA dinucleotides via an alternative mechanism. Mobile DNA 2018; 9. 

9. Guo Y, Updegraff BL, Park S, Durakoglugil D, Burton V, Maddux S, Hwang TH, O’Donnell KA*. Comprehensive ex vivo transposon mutagenesis identifies novel drivers of human leukemogenesis. Cancer Research 2016 Feb 15;76(4):773-786.

10. Guo Y#, Park JM#, Cui B, Humes E, Gangadharan S, Hung S, FitzGerald PC, Hoe KL, Grewal SI, Craig NL, Levin HL*. Integration profiling of gene function with dense maps of transposon integration. Genetics 2013 Oct;195(2):599-609. 

11. Guo Y, Levin HL*.  High-throughput sequencing of retrotransposon integration provides a saturated profile of target activity in Schizosaccharomyces pombe. Genome Research 2010 Feb;20(2):239-48. Epub 2009 Dec 29. 

12. Guo Y, Chen C, Zheng Y, Zhang J, Tao X, Liu S, Zheng D* and Liu Y*. A novel anti-human DR5 monoclonal antibody with tumoricidal activity induces caspase-dependent and caspase-independent cell death. J. Biol. Chem. 2005 Dec 23;280(51):41940-52.

(#并列第一作者;*通讯作者)