我院普通外科下设乳腺肿瘤中心、肝胆外科、胆胰外科、胃肠外科、血管外科、甲状腺外科等6个亚专科，还有1个普通外科重症监护室（SICU）、2个实验室、1个临床组织标本库、1个随访办公室及《岭南现代临床外科》杂志编辑部。宋尔卫院士和王捷教授为学科带头人，陈亚进教授任科主任，李文滨教授、聂燕教授任科副主任。

我院普通外科是国家临床重点专科，是华南地区规模最大和整体实力最强的同类专科之一，在2018年度华南医院最佳专科排行榜（复旦版）位列第二。同时是中国临床肿瘤学会乳腺癌专业委员会候任主委单位，中国抗癌协会乳腺癌专委会、中国医师协会乳腺外科和肝脏外科专委会等副主委单位，是亚太肝脏外科培训中心（华南唯一）等负责单位，是华南地区重要的继续教育基地，带动了华南乃至全国相关领域医疗水平的提高。

科室现开放床位400余张，年门诊患者超十万人次、住院患者两万多人次、手术近两万台。科室以乳腺肿瘤、肝胆胰肿瘤、胃肠肿瘤、甲状腺肿瘤等的精准外科治疗为重点方向，乳腺癌保乳手术率常年达50%以上，五年生存率91.8%，居国内领先；是华南地区唯一能全方位开展各种高难度消化系统肿瘤微创手术的专科；近年引入全球最先进的达芬奇机器人系统，进一步推动复杂手术微创化。临床技术水平尤其是微创技术水平处于国际先进、国内领先水平，成为华南地区最大的消化系统肿瘤疑难诊治中心和国内最著名的三大肝胆胰微创手术中心之一。2019年我科重新获得肝脏移植资质，在刘超副院长的带领下目前开展的肝脏移植均达省内先进水平。

学科建设方面各亚专科齐头并进、蓬勃发展又各有特色；人才建设方面取得显著成效。科室现有医师130余人，其中博士、硕士研究生导师超过50人；学科带头人宋尔卫教授入选中组部首批和中国科学院院士。科室近年来共发表200余篇SCI论文，其中包括《Nature Reviews Drug Discovery》、《Cell》、《Cancer Cell》、《Gut》、《Hepatology》等本领域顶级杂志；获得了包括国家自然科学基金创新研究群体项目、国家自然科学基金重大重点项目等在内的100余项科研项目，总资助经费达超一亿元；2015年获国家自然科学二等奖。