黄林团队开发第一个天然核酶数据库在Nucleic Acids Research杂志发表

论文题目：Ribocentre: a database of ribozymes     

通讯作者：黄林 等

第一作者：邓洁；彭雪梅 等

论文发表刊物：Nucleic Acids Research

【研究背景】

核酶是具有催化功能的RNA分子，在肽键形成、RNA剪接、tRNA生物合成和病毒复制等一系列重要的生物催化反应中发挥作用。迄今为止，共21个具有不同功能的天然核酶家族被陆续发现。但是一直没有一个全面的天然核酶数据库，便于研究者系统、深入地理解已知的天然核酶。

【主要发现】

本研究通过对多个数据库搜索、手工收集等方法对天然核酶的信息进行了完善的调查和收集。基于几个实验室对核酶的多年研究经验,对数据进行总结归纳。最终开发出了第一个核酶数据库：Ribocentre（https://www.ribocentre.org/）。Ribocentre包含来自21个核酶家族的16886个序列，290多篇描述性参考文献，165个已经确定的核酶结构以及48种不同的核酶应用（图1）。

图1

【研究意义】

本研究开发了第一个天然核酶数据库—Ribocentre，包括所有已知天然核酶的研究历史、序列、结构、机制以及相关的应用，为用户提供了一种简单、灵活的方式来浏览过去40年来所有的天然核酶。结构是以交互形式存放（图2），便于用户理解核酶“序列-结构-功能”之间的关系，以促进核酶的应用以及新核酶的发现。

图2

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